1942 года под его руководством части дивизии отбили сильную атаку превосходящих сил противника, нанеся ему большой урон в живой силе и технике, тем самым обеспечили взятие Красной Горки и дер. Красный Октябрь» (из наградного листа). 23.5.1942 полковник А. П. Мальцев был допущен к командованию 352-й стрелковой дивизией, которая в составе 5-й армии находилась в обороне в районе Гжатска. 4 февраля 1943 г. освобожден от командования и зачислен в резерв фронта, затем в том же месяце назначен командиром 4-й отдельной стрелковой бригады и воевал с ней в 16-й и 50-й армиях. В составе последней в марте участвовал в Ржевско-Вяземской наступательной операции 1943 г. В июне на базе этой и 125-й стрелковых бригад была сформирована 212-я стрелковая дивизия, а полковник А. П. Мальцев утвержден ее командиром. В июле ее части в составе той же 50-й армии участвовали в Курской битве, Орловской наступательной операции. Форсировав р. Жиздра, они прорвали оборону немцев, продвинулись на 12-15 км, после чего перешли к обороне. С 9 августа дивизия перешла в подчинение 10-й армии Западного фронта и участвовала в Смоленской, Смоленско-Рославльской наступательных операциях, в освобождении городов Рославль и Кричев. С выходом на восточный берег р. Проня она перешла к обороне, затем выведена в резерв 10-й армии. Приказом ВГК от 30.9.1943 ей было присвоено наименование «Кри-чевская», а ее командир за эти бои приказом по войскам Западного фронта от 7.3.1944 награжден орденом Красного Знамени. В декабре 1943 г. освобожден от командования и в феврале 1944 г. командирован на КУВНАС при Высшей военной академии им. К. Е. Ворошилова, а после их окончания в мае зачислен слушателем основного курса. В январе 1945 г. окончил ее и убыл в распоряжение Военного совета 3-го Белорусского фронта, где был назначен зам. командира 71-го стрелкового корпуса 31-й армии. С 29 января 1945 г. допущен к исполнению должности командира 88-й стрелковой Витебской Краснознаменной ордена Суворова дивизии. Участвовал с ней в Восточно-Прусской, Инстербургско-Кёнигсбергской наступательных операциях, в уничтожении хейльсбергской группировки противника в Восточной Пруссии. В конце февраля отстранен от командования и 2 апреля назначен зам. командира 50-й гвардейской стрелковой Сталинской дважды Краснознаменной ордена Суворова дивизии. На заключительном этапе войны в апреле – мае она участвовала в Берлинской и Пражской наступательных операциях. После войны продолжал служить в той же дивизии в Барановичском ВО, а с марта 1946 г. – БВО. С июля по ноябрь 1947 г. состоял в распоряжении командующего войсками округа, затем был назначен руководителем тактики Объединенных КУОС Таврического ВО. 11.6.1949 отстранен от должности и зачислен в распоряжение командующего войсками округа. С сентября 1949 г. исполнял обязанности старшего преподавателя военной кафедры Запорожского института сельскохозяйственного машиностроения. 18.7.1953 уволен в запас. Воинские звания: полковник (27.06.1942). Награжден орденом Ленина, 3 орденами Красного Знамени, орденом Кутузова 2-й ст., медалями.
