Кому мешает ДНК-генеалогия? Ложь, инсинуации, и русофобия в современной российской науке. А. А. Клёсов
Чтение книги онлайн.
Читать онлайн книгу Кому мешает ДНК-генеалогия? Ложь, инсинуации, и русофобия в современной российской науке - А. А. Клёсов страница 60
Название: Кому мешает ДНК-генеалогия? Ложь, инсинуации, и русофобия в современной российской науке
Автор: А. А. Клёсов
Издательство: НЕФОРМАТ
Жанр: Биология
Серия: ДНК-генеалогия
isbn: 978-5-8041-0842-8
isbn:
13 25 16 11 11 14 12 12 10 13 11 18
13 25 16 11 11 14 12 12 10 13 11 18
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 17
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 18
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 18
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 18
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 18
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 18
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 18
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 18
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 18
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 18
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 19
13 25 16 11 11 14 12 12 10 14 11 19
13 25 16 11 11 14 12 12 10 15 11 17
13 25 17 11 11 14 12 12 10 14 11 18
13 26 16 11 11 11 12 12 10 14 11 17
Девять из них идентичны друг другу, это – базовые, или предковые гаплотипы. Они не успели мутировать за время, прошедшее от их общего предка. На все 27 гаплотипов приходится 27 мутаций (отмечены жирным шрифтом). Иначе говоря, за время, прошедшее от их общего предка, девять 12-маркерных гаплотипов полностью сохранились, 18 гаплотипов приобрели мутации. Популяционный генетик рассчитал бы «коэффициент разнообразия» гаплотипов, который никому и никогда не нужен, и на этом бы свою работу закончил соответствующей публикацией, а рецензент в журнале, тоже, естественно, попгенетик, статью бы без вопросов пропустил в печать. То, что это фактически мусор, ему бы и в голову не пришло, там «наука» такая. На самом деле эта серия гаплотипов позволяет расчитать, когда жил общий предок этих гаплотипов, и далее, прослеживая подобные гаплотипы по территориям, и каждый раз рассчитывая времена жизни общих предков, можно понять, в какую сторону направлялись древние миграции, и сопоставляя полученные данные с археологическими и лингвистическими показателями, можно получать более содержательные картины прошлого.
Рис. 11. Расчет времени до общего предка для 27 гаплотипов в 12-маркерном формате из Киргизского проекта FTDNA. Поскольку гаплотипы 12-маркерные, то же расстояние до общего предка (TMRCA), 1304±283 лет, повторено в колонке для 225-, 37-, 67- и 111-маркерных гаплотипов. Колонка для 6-маркерных гаплотипов показывает 1425±453 лет до общего предка, что является тем же самым в пределах погрешности расчетов. Остальными колонками следует пренебречь.
Так вот, рассчитать время жизни общего предка можно разными способами. Можно – используя все 12 индивидуальных констант (k) скоростей мутаций, и считать по каждому маркеру, раздельно. Их величины приведены выше, в ответах на вопрос 65. Тогда результатом расчета будет набор из 12 «времен жизни до общего предка», который следует усреднить Это – очень непродуктивный метод расчета, и так вручную никто не считает (тем более всего для 27 гаплотипов, с крайне бедной статистикой). Но это – основа для машинных (компьютерных) расчетов, особенно для сотен и тысяч гаплотипов, и итоговое усреднение проводится по всему полю данных. Именно так работает калькулятор Килина-Клёсова[66], в который заложены значения констант скоростей для 111 маркеров, и расчет проводится по массиву данных до 10 тысяч гаплотипов практически в любом формате. Время расчета даже для 10 тысяч 111-маркерных гаплотипов занимает всего несколько секунд. В данном случае у шести маркеров из 12 мутаций нет, так что для них формальное «время до общего предка» равно нулю, но оно усредняется с результатами по шести оставшимся маркерам, и суммарно оно оказывается равно 1304±283 лет до общего предка (без округлений). Скриншот калькулятора с СКАЧАТЬ
Клёсов, А.А., Килин, В.В. (2015) Калькулятор Килина-Клёсова для расчета времен до общих предков (TMRCA): новое издание. Вестник Академии ДНК-генеалогии, т. 8, № 3, стр. 321–375.